Médico autónomo: IRPF, IVA exento y particularidades fiscales

La exención de IVA en los servicios médicos: la clave fiscal del médico autónomo

La particularidad fiscal más importante del médico que ejerce por cuenta propia es la exención de IVA en sus servicios. A diferencia de la mayoría de profesionales autónomos, el médico no cobra IVA a sus pacientes, pero esto tiene consecuencias que van más allá del simple ahorro para el paciente.

Qué dice la ley: exención del IVA en servicios sanitarios

El artículo 20.Uno.3.º de la Ley del IVA (LIVA) establece la exención para:

“La asistencia a personas físicas por profesionales médicos o sanitarios, cualquiera que sea la persona destinataria de dichos servicios.”

Esta exención aplica cuando el servicio cumple dos condiciones:

1. Es prestado por un profesional médico o sanitario (médico, odontólogo, enfermero, fisioterapeuta, etc.).
2. Tiene por finalidad la protección, mantenimiento, restablecimiento o vigilancia de la salud humana.

Servicios médicos exentos de IVA (ejemplos)

• Consultas médicas generales y de especialidades.
• Intervenciones quirúrgicas con finalidad terapéutica.
• Servicios de diagnóstico (análisis clínicos, radiología, ecografías).
• Servicios de urgencias.
• Atención psiquiátrica y psicológica (con matices).
• Servicios de medicina preventiva y vacunación.
• Atención domiciliaria.

Servicios médicos NO exentos de IVA (sujetos al 21% o 10%)

No toda actividad realizada por un médico está exenta. La finalidad es determinante:

Consecuencias de la exención de IVA para el médico autónomo

No puedes deducirte el IVA soportado en gastos de la actividad exenta

Esta es la consecuencia más importante y frecuentemente malentendida. Un médico autónomo que compra un ecógrafo por 20.000 € + 4.200 € de IVA no puede deducirse esos 4.200 € de IVA en su declaración trimestral, porque su actividad es exenta y no genera IVA repercutido con el que compensar.

El IVA soportado en actividades exentas es un coste real de la actividad.

¿Qué pasa si tienes actividades mixtas (exentas y no exentas)?

Si el médico realiza tanto servicios exentos (consulta clínica) como servicios no exentos (peritajes), debe aplicar la regla de la prorrata:

• Solo puede deducirse el IVA soportado en proporción al volumen de operaciones no exentas respecto al total.
• Si el 90% de su facturación es de consulta médica (exenta) y el 10% de peritajes (no exentos), solo puede deducirse el 10% del IVA soportado en gastos comunes.

Alta como médico autónomo: trámites específicos

Colegiación obligatoria

Para ejercer la medicina en España es obligatorio estar colegiado en el Colegio Oficial de Médicos de la provincia. Sin colegiación, el ejercicio es ilegal.

Epígrafe del IAE

Seguro de responsabilidad civil profesional

El seguro de RC es prácticamente obligatorio para el médico que ejerce de forma privada. Muchos colegios lo ofrecen como parte de la cuota colegial, pero conviene revisar los capitales asegurados.

IRPF del médico autónomo

Retenciones en las facturas

Como profesional, el médico que emite facturas a empresas aplica retención de IRPF del 15% (7% los tres primeros años de actividad).

Sin embargo, muchos médicos trabajan directamente con pacientes particulares, que no tienen obligación de retener. En esos casos, el médico no aplica retención en la factura pero sí debe hacer pagos fraccionados trimestrales de IRPF (modelo 130).

Pago fraccionado IRPF (modelo 130)

En estimación directa simplificada, el médico debe presentar el modelo 130 trimestralmente, ingresando el 20% del rendimiento neto del trimestre menos las retenciones soportadas.

Si la mayor parte de sus ingresos proviene de hospitales o clínicas que le retienen el 15%, puede estar exento del modelo 130 si las retenciones superan el 70% del pago fraccionado que correspondería.

Gastos deducibles del médico autónomo

En IRPF, el médico puede deducir todos los gastos necesarios para el ejercicio de su actividad:

Consulta y equipamiento médico

Nota: el IVA soportado en todos estos gastos NO es deducible para el médico con actividad exclusivamente exenta. Forma parte del coste del bien o servicio.

Formación y actualización

Previsión social

La Mutualidad del Colegio de Médicos como alternativa al RETA

Algunos colegios de médicos disponen de mutualidades de previsión social alternativas al RETA. Sin embargo, a diferencia de los abogados (que tienen reconocida legalmente la alternativa al RETA), los médicos no tienen una alternativa legalmente reconocida como sustitutiva del RETA.

Esto significa que el médico autónomo está obligado a cotizar en el RETA y puede, adicionalmente, complementar su previsión con seguros privados o planes de pensiones.

Medicina privada: cuándo tributar y cómo

Guardia locum o suplencias en clínica privada

Si un médico realiza guardias o suplencias en una clínica privada, puede tener una relación laboral (contrato) o mercantil (factura). Las implicaciones son diferentes:

Médico en sociedad profesional

Algunos médicos ejercen a través de una sociedad profesional o una SL. En ese caso:

• La sociedad tributa por Impuesto de Sociedades (25%).
• El médico socio-trabajador recibe una nómina y/o dividendos.
• El tratamiento de los servicios médicos (exención de IVA) se traslada a la sociedad.

Modelo de factura del médico autónomo con servicios mixtos

Factura por consulta médica (exenta de IVA)

Concepto: Consulta médica especializada
Base imponible:    150,00 €
IVA: Exento (Art. 20.Uno.3.º LIVA)
Total:             150,00 €

Factura por peritaje médico (sujeto a IVA)

Concepto: Informe pericial médico - expediente 2026/123
Base imponible:    500,00 €
IVA 21%:           +105,00 €
IRPF 15%:          - 75,00 €
Total a pagar:     530,00 €

Preguntas frecuentes

¿La psicología está exenta de IVA igual que la medicina? Sí, los servicios de los psicólogos sanitarios (con habilitación sanitaria) están exentos del IVA cuando tienen finalidad terapéutica. Los servicios de coaching o psicología no sanitaria no están exentos.

¿Puedo deducirme el IVA de los gastos del despacho en casa? Si tu actividad es exclusivamente exenta, no. Si tienes actividades mixtas (consulta exenta + peritajes sujetos), puedes deducirte el IVA en proporción a la prorrata.

¿La medicina del trabajo para empresas lleva IVA? Sí. Los reconocimientos médicos para empresas (vigilancia de la salud de trabajadores) son servicios sujetos al IVA del 21%, ya que su finalidad no es directamente terapéutica para el paciente.

¿Qué ocurre con el IVA de los servicios de telemedicina? Si la telemedicina tiene finalidad sanitaria y es prestada por un médico titulado, está exenta de IVA igual que la consulta presencial.